水生生物eDNA数据库

(Aquatic environmental DNA database, AeDNA )

        AeDNA是由水生生物DNA条形码和基因组组成的eDNA数据库,涉及生物类群包括2万余种鱼类、1万余种水生植物、1万余种浮游动物和1万余种浮游植物;生境类型覆盖江、河、湖、海、冰川和温泉等各类水环境;数据类型包含18S、28S、ITS、CO1、12S、rbcL等条形码序列以及线粒体、叶绿体等细胞器基因组和物种全基因组序列。

        数据库收集了近60万余条eDNA序列,其中AeDNA团队贡献了6万余条。AeDNA依托中国科学院水生生物研究所水生生物鉴定中心、水生生物数据分析管理平台、超级计算平台和湖北省生态环境科学研究院,旨在实现水生生物的调查、监测、追溯和预警的综合能力。

DNA条形码
基因组*
浮游植物
水生植物
浮游动物
底栖动物
鱼类
两栖动物

承担项目

  • 重要生物类群DNA条码数据库的建设

  • 长江流域鱼类环境DNA试点监测项目

  • 我国重要渔业生物DNA条形码的数据采集